Whole genome characterization, and geographical distribution of M. tuberculosis in central region of Veracruz, Mexico

ABSTRACT The purpose of this work was to perform by Whole Genomic Sequencing (WGS) a characterization of tuberculosis isolates circulating in the central region of Veracruz, Mexico, and to determine its geographical distribution. The genome of 25 clinical isolates of tuberculosis patients, recovered from central zone of Veracruz, Mexico, were sequenced and the information obtained was used to characterize lineage, prediction of drug resistance, identification of clonal complexes, and finally correlated with the geolocalization data. Isolates analyzed were included into seven L4 sublineages, most frequent was X3; X1 (4.1.1.3) in 35%. rpoBSer450Leu polymorphism was the most frequently found variant. Sublineage Haarlem (4.1.2) had the widest distribution, found in five municipalities. Of the of two clonal complexes found, the most abundant included eight isolates, with X3/X1 lineage, placed in two municipalities. Combination of WGS and geographic information system was very useful for the identification of sublineages, clonal complexes, and their geographical dispersion with important implications in the epidemiological surveillance and clinical control of TB.

Evaluación de la deficiencia de vitamina A en niños menores de 5 años con infecciones respiratorias y diarréicas agudas por el Método de Citología de Impresión Conjuntival (CIC) / Evaluation of the vitamin A deficiency in children under 5 years with respiratory infections and acute diarrheal by the Conjunctival Impression Cytology Method (CIC)

Introducción: La deficiencia de vitamina A (DVA) es un problema de salud pública en países pobres y afecta principalmente a niños pequeños. La manifestación clínica más frecuente de la DVA es la ceguera nocturna y cambios en el epitelio ocular, que se denominan Xeroftalmía. Estos cambios pueden evaluarse en forma precoz mediante un método de diagnóstico conocido como Citología de Impresión Conjuntival (CIC). Objetivo: Determinar la DVA en niños menores de 5 años con el método de CIC. Diseño: Estudio descriptivo, transversal con muestreo probabilístico. Institución: Servicio de Pediatría del Hospital Nacional E. Rebagliati M. y Centro de Educación Inicial (CEI) Modelo, de EsSalud. Participantes: 103 niños menores de 5 años, en el periodo setiembre 1999 a febrero 2000. Intervenciones: La población de estudio se distribuyó en dos grupos; uno constituido por 45 niños sanos del CEI Modelo y el otro constituido por 58 niños enfermos que fueron hospitalizados por infección respiratoria aguda (IRA) o por enfermedad diarreica aguda (EDA).Principales medidas de resultados: Indice nutricional Peso/Talla (P/T), CIC normal y CIC anormal. Resultados: EI estado nutricional se midió mediante el indicador P/T resultando adecuado o normal en 68.9 por ciento de niños sanos, y en 86.2 por ciento de niños enfermos. Se encontró niños con sobrepeso en el grupo de sanos (31.1 por ciento) y en el grupo de enfermos (3.4 por ciento). Los niños menores de 2 años fueron los más afectados por IRA y EDA, en 60.3 por ciento de casos; y dentro de las IRA se presentaron con mayor frecuencia la neumonía y bronconeumonía, en 45.7 por ciento. El método CIC se aplicó a todos los niños estudiados y resultó anormal en 4.4 por ciento de los niños sanos y en 63.8 por ciento de los niños hospitalizados por IRA y EDA; encontrándose asociación estadística significativa (p<0.05) al comparar ambos grupos de niños respecto al resultado de CIC. Conclusiones: El hallazgo de CIC anormal con mayor frecuencia...

Introduction: The vitamin A deficiency (VAD) is a problem of public health in poor countries and this affect especially infants and toddlers. The clinic manifestation more frequent of VAD is night blindness and change in the ocular epithelium that these name Xerophthalmia. These processes may assess precociously whit method of conjuntival impression citology (CIC). Objectives: To determine VAD in children under 5 years of age by method of CIC. Design: Descriptive, transversal study with probability sampling. Institution: Department of Pediatrics at National Hospital E. Rebagliati M. and Model CEI, both from EsSalud. Participants: 103 children under 5 years of age in the period between September- 99 and February 2000. Interventions: The study population was distributed into two groups; one consisting of 45 healthy children of Model CEI, and the other consisting of 58 children ill, hospitalized in the Department of Pediatrics at Rebagliati Hospital with acute respiratory infection (ARI) and acute diarrhea (AD). Main outcome measures: Nutritional index Weight/Height (W/H), normal CIC, abnormal Cle. Results: Nutritional status was assessed index W/H resulting in adequate or normal in 68.9 per cent of healthy children and 86.2 per cent of sick children. Overweight children were found in the healthy group (31.1 per cent) and the group of sick (3.4 per cent). The children under two years olds were the most affected by ARI and AD, by 60.3 per cent; and inside of ARI occurred more frequently pneumonia and bronchopneumonia, by 45.7 per cent. The method CIC was applied to all children studied, and was abnormal en 4.4 per cent of healthy children and in 63.8 per cent of children hospitalized by ARI and AD, founding a statistically significant association (p<0.05) when comparing both groups of children regarding the outcome of CIC. Conclusions: The finding of abnormal CIC mainly in hospitalized children by ARI and AD suggests that there is evidence of VAD.

Evaluación de la actividad genética de los medicamentos meprobamato y pirimetamina en Aspergillus nidulans / Evaluation of genetic activity of meprobamate and pirimetamine on Aspergillus nidulans

El objetivo de este trabajo es estudiar la actividad genética como inductores de recombinación mitótica y de delecciones, de dos medicamentos: meprobamato y pirimetamina, utilizando el ascomiceto Aspergillus nidulans como organismo de ensayo. Para el primer caso se utilizó una cepa diploide heterocigótica para marcadores del color de los conidios, y en el segundo caso, la cepa llevaba una duplicación de parte del genoma en el grupo de ligamento II. Para cada medicamento se probaron varias concentraciones diferentes; 6 para el meprobamato y 4 para la pirimetamina. Los resultados obtenidos indican que el meprobamato induce delecciones a las dosis de 10mM, 5mM y 2,5mM. La pirimetamina, a su vez, presentó un efecto positivo como inductora de recombinación mitótica a la dosis de 50*g/ml. Estos resultados indican que estos medicamentos, de amplio uso en nuestro país, presentan cierto tipo de actividad genética, detectada en las condiciones experimentales usadas por nosotros en este trabajo